处理医患纠纷的部门是：
可以找医院的领导反映情况，并协商进行赔偿，如果无法协商处理的，可以向当地的卫生局举报，通过行政诉讼的方式对医院提出诉讼，由行政机关根据实际情况来进行处理。
1.向医院医保科或者医院领导反映个人情况，与其进行协商维护自身利益;
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2.向当地市、区卫生监督局拨打投诉电话或者拨打全国统一卫生热线。
找法网提醒您，身体受到伤害要求赔偿的，患者应当在从知道或应当知道权利被侵犯时起一年内向医院所在地人民法院提起诉讼，超出诉讼时效后就会失去法律的保护，法院会作出不予受理或驳回起诉的裁判。
二、医患纠纷的类型主要是医疗纠纷、医疗事故这两种。
1.医疗纠纷
医疗纠纷是指基于医疗行为，在医方(医疗机构)与患方(患者或者患者近亲属)之间产生的因医疗过错、违约而导致的医疗损害赔偿及医疗合同违约等纠纷，它通常是由医疗过错和过失引起的。医患双方发生医疗纠纷，可以选择侵权责任或违约责任要求对方承担责任。
2.医疗事故
医疗事故是指医疗机构及其医务人员在医疗活动中，违反医疗卫生管理法律、行政法规、部门规章和诊疗护理规范、常规，过失造成患者人身损害的事故。根据对患者人身造成的损害程度，医疗事故分为四级。
三、处理医疗事故，应当遵循公开原则、公平原则、公正原则、及时原则、便民原则。医疗事故是指医疗机构及其医务人员在医疗活动中，违反医疗卫生管理法律、行政法规、部门规章和诊疗护理规范、常规，过失造成患者人身损害的事故。
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